Mais de metade dos 53 projectos que vão ser financiados pela FCT pertencem às duas universidades, que assim se destacam das outras dez instituições de ensino superior de todo o país que viram também os seus projectos aprovados.

Das 176 investigações que se candidataram a receber financiamento, apenas foram aprovadas 29 da área da economia e 26 de gestão. Embora com um número menor de projectos aprovados, a investigação em gestão recebe um financiamento maior. De um total de 12 milhões de euros pedidos pelas universidades, a FCT só vai atribuir 20,2 por cento de verba. Já na economia, a fundação financia 19 por cento dos projectos (cerca de 1,13 milhões de euros), de um total de sete milhões de euros solicitados.

Segundo Eduardo Inês, um dos gestores dos projectos da FCT para as áreas científicas, os resultados do concurso de 2006 reflectem, sobretudo, quatro critérios: "originalidade da proposta, o seu mérito científico, a qualidade da equipa de investigação e viabilidade do orçamento proposto".